Редактировал сегодня  twenty fifteen wordpress тему и уже убрал все лишние padding и margin, но все равно было много отступов и контент казался разбросанным. Потом посмотрел немного коды страниц и увидел, что для браузера интернет-эксплорер подтягивается еще файл html.js, и там есть коды дополнительных отступов.

Для того, чтобы их убрать нужно зайти в папку с темой, далее в папку JS и найти там файл html.js. Открываем его. Можно все удалить, а можно только нужный нам отрывок. Вот он (в принципе это все, что не закодировано под описание):

(function(l,f){function m(){var a=e.elements;return»string»==typeof a?a.split(» «):a}function i(a){var b=n[a[o]];b||(b={},h++,a[o]=h,n[h]=b);return b}function p(a,b,c){b||(b=f);if(g)return

b.createElement(a);c||(c=i(b));b=c.cache[a]?c.cache[a].cloneNode():r.test(a)?
(c.cache[a]=c.createElem(a)).cloneNode():c.createElem(a);return

b.canHaveChildren&&!s.test(a)?c.frag.appendChild(b):b}function t(a,b){if(!b.cache)b.cache=

{},b.createElem=a.createElement,b.createFrag=a.createDocumentFragment,b.frag=b.createFrag(); a.createElement=function(c){return!e.shivMethods ?

b.createElem(c):p(c,a,b)};a.createDocumentFragment=Function(«h,f»,»return function(){var n=f.cloneNode(),c=n.createElement;h.shivMethods&&

(«+m().join().replace(/[\w\-]+/g,function(a){b.createElem(a);b.frag.createElement(a);return’c(«‘+a+'»)’})+»);return n}»)

(e,b.frag)}function q(a){a||(a=f);var b=i(a);if(e.shivCSS&&!j&&!b.hasCSS){var c,d=a;c=d.createElement(«p»);d=d.getElementsByTagName(«head»)

[0]||d.documentElement;c.innerHTML=»x<style>article,aside,dialog,figcaption,figure,footer,

header,hgroup,main,nav,section{display:block}mark{background:#FF0;color:#000}template{display:none}</style>»;

c=d.insertBefore(c.lastChild,d.firstChild);b.hasCSS=!!c}g||t(a,b);return a}var k=l.html5||

{},s=/^<|^(?:button|map|select|textarea|object|iframe|option|optgroup)$/i,r=/^(?:a|b|code|di

v|fieldset|h1|h2|h3|h4|h5|h6|i|label|li|ol|p|q|span|strong|style|table|tbody|td|th|tr|ul)$/i,j,o=»_

html5shiv»,h=0,n={},g;(function(){try{var a=f.createElement(«a»);a.innerHTML=»<xyz>

</xyz>»;j=»hidden»in a;var b;if(!(b=1==a.childNodes.length)){f.createElement(«a»);var

c=f.createDocumentFragment();b=»undefined»==typeof c.cloneNode||

«undefined»==typeof c.createDocumentFragment||»undefined»==typeof
c.createElement}g=b}catch(d){g=j=!0}})();var e={elements:k.elements||»abbr article aside
audio bdi canvas data datalist details dialog figcaption figure footer header hgroup main

mark meter nav output progress section summary template time

video»,version:»3.7.0″,shivCSS:!1!==k.shivCSS,supportsUnknownElements:g,shivMethod

s:!1!==k.shivMethods,type:»default»,shivDocument:q,createElement:p,createDocumentFra

gment:function(a,b){a||(a=f); if(g)return a.createDocumentFragment();for(var

b=b||i(a),c=b.frag.cloneNode(),d=0,e=m(),h=e.length;d<h;d++)c.createElement(e[d]);retur

n c}};l.html5=e;q(f)})(this,document);

Можно было конечно и в нем поколупаться, уменьшить отступы, но я решил просто удалить
Кстати, файл нашел в этом коде:

<!—[if lt IE 9]> <script src=»<?php echo esc_url( get_template_directory_uri() ); ?>/js/html5.js»></script> <![endif]—>